الأستاذ محمد خلفاوي حاصل على شهادة الدكتوراه تخصص الرياضيات والرياضيات التطبيقية من جامعة مونبيلييه 2 بفرنسا. التحق بوزارة التعليم العالي والبحث العلمي أواخر سنة 1997 وشغل بها منصب رئيس مصلحة التعليم العالي والتكنولوجي إلى غاية سنة 2003 حيث التحق بجامعة محمد الخامس كأستاذ باحث بالمدرسة العليا للتكنولوجيا بسلا.
خلال مساره المهني تقلد عدة مهام منها كاتبا عاما لجامعة ابن زهر، ثم كاتبا عاما لجامعة محمد الخامس كدال بالرباط، ثم مديرا للمدرسة العليا للتكنولوجيا بسلا، ومديرا للمركز الوطني للبحث العلمي والتقني.
التحق الأستاذ محمد خلفاوي مجددا بوزارة التربية الوطنية والتكوين المهني والتعليم العالي والبحث العلمي ليشغل منذ مارس 2020 إلى اليوم منصب كاتبا عاما لقطاع التعليم العالي والبحث العلمي.
أما على المستوى الأكاديمي، فللأستاذ محمد خلفاوي العديد من الأنشطة البحثية والمنشورات العلمية الدولية والوطنية وأشرف على العديد من أطروحات الدكتوراه وشارك في مناقشة عدة أطروحات.